31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4250 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  636    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  32.65 
 
 		 394 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  31.97 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  30.79 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  29.9 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  27.22 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  25.9 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  29.38 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  31.76 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  35.34 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  28.9 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  35.38 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  33.33 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  27.81 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  32.2 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  31.67 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  25.96 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  25 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  25.71 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  25.8 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  26.9 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2674  hypothetical protein  31.07 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  35.86 
 
 		 430 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  25.97 
 
 		 398 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  27.01 
 
 		 398 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  25.97 
 
 		 398 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1848  hypothetical protein  26.28 
 
 		 285 aa  46.2  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  26.48 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  25.7 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  25.7 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04021  hypothetical protein  26.53 
 
 		 249 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.494357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>