29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4818 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  720    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  30.62 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  31.77 
 
 		 394 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  25.06 
 
 		 514 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  28.05 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  31.68 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  29.61 
 
 		 392 aa  89.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  27.37 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  30.25 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  27.07 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  24.69 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  30.18 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  29.01 
 
 		 479 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  26.7 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  29.53 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  35.56 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  27.44 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  27.94 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  27.94 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  27.94 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  26.84 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  26.52 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  37.39 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  22.77 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  28.77 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  23.72 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  28.46 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2253  hypothetical protein  27.87 
 
 		 285 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2090  hypothetical protein  39.39 
 
 		 218 aa  43.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.862731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>