46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0383 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  41.82 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1503  protein of unknown function DUF975  39.18 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  40.38 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  36.21 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  38.97 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  36.76 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  34.96 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2424  hypothetical protein  33.72 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.129436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  32.24 
 
 		 245 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  34.58 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  28.77 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  29.34 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  26.83 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  25.79 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  30.56 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  23.87 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  24.64 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  24.79 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  27.27 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  24.89 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  24.89 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  25.11 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  28.49 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00710  hypothetical protein  31.54 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  27.03 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  25.11 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2976  hypothetical protein  30.65 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  30.14 
 
 		 313 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  25.23 
 
 		 327 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  29.55 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0384  hypothetical protein  32.93 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5100  hypothetical protein  27.74 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4984  hypothetical protein  24.09 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0797538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5152  hypothetical protein  24.09 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000285957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5393  hypothetical protein  24.09 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.62077e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5002  hypothetical protein  24.09 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5544  hypothetical protein  24.09 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000271519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5527  integral membrane protein  25.38 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000108543  hitchhiker  0.0000000242358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4960  hypothetical protein  32.22 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5427  hypothetical protein  25.74 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07940  hypothetical protein  32.52 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267226  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  26.95 
 
 		 311 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5479  integral membrane protein  26.19 
 
 		 146 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0425  hypothetical membrane spanning protein  21.6 
 
 		 262 aa  41.6  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.800318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>