38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4886 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  92.24 
 
 		 245 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  58.4 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  32.71 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  30.08 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  31.16 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2976  hypothetical protein  32.07 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  33.33 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  31.54 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  28.76 
 
 		 226 aa  92.4  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  26.61 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  27.47 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  28.95 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0425  hypothetical membrane spanning protein  22.75 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.800318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1749  hypothetical protein  22.75 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000252365  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  27.12 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  26.09 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  25.43 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1503  protein of unknown function DUF975  42.68 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  24.76 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5527  integral membrane protein  24.75 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000108543  hitchhiker  0.0000000242358 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  29.84 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1579  membrane protein  26.29 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2424  hypothetical protein  27.96 
 
 		 267 aa  48.5  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.129436 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5427  hypothetical protein  25.25 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  26.67 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5544  hypothetical protein  22.61 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000271519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5002  hypothetical protein  22.61 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5393  hypothetical protein  22.61 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.62077e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5152  hypothetical protein  22.61 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000285957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2194  protein of unknown function DUF975  25.93 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  23.67 
 
 		 317 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  23.67 
 
 		 317 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  25.66 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4984  hypothetical protein  22.11 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0797538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2662  hypothetical protein  27.22 
 
 		 490 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  21.7 
 
 		 335 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  26.19 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>