30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2212 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  584  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  35.57 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  35.57 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  31.56 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  34.63 
 
 		 452 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  35.65 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  35.31 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  34.05 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  31.49 
 
 		 250 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  30.42 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  31.38 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  31.56 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0661  hypothetical protein  34.52 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  31.71 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  31.55 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  26.03 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3440  hypothetical protein  32.35 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.744208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0158  hypothetical protein  32.3 
 
 		 189 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01546  transcription factor (Sin3), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05570)  31.67 
 
 		 1605 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  36.9 
 
 		 2272 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  36.67 
 
 		 2179 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  35.05 
 
 		 1646 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04280  Rho guanyl-nucleotide exchange factor, putative  36.46 
 
 		 1296 aa  46.6  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.666845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  27.86 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  38.55 
 
 		 2397 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  27.81 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  25.87 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  48 
 
 		 1049 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  50.85 
 
 		 499 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>