33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4673 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  63.45 
 
 
317 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  63.45 
 
 
317 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  64.32 
 
 
229 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  49.78 
 
 
335 aa  208  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  38.85 
 
 
295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  38 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  38.63 
 
 
325 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  38.52 
 
 
314 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  30.77 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  30.21 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  30.45 
 
 
452 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  30.09 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  23.95 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  48 
 
 
1821 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  26.95 
 
 
225 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  27.38 
 
 
266 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  22.12 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  44.09 
 
 
1079 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  36.14 
 
 
2179 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  26.72 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  29.92 
 
 
218 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  34.07 
 
 
2272 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  28.46 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0029  FHA domain-containing protein  46.15 
 
 
470 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  29.51 
 
 
218 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  38.89 
 
 
3322 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07940  hypothetical protein  34.91 
 
 
245 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267226  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03900  eukaryotic initiation factor 4F subunit P130, putative  38.38 
 
 
1494 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  24.93 
 
 
439 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3440  hypothetical protein  25.56 
 
 
190 aa  42.7  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.744208  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10020  hypothetical protein  43.62 
 
 
527 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>