30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4379 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  99.56 
 
 		 317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  99.56 
 
 		 317 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  64.32 
 
 		 323 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  49.56 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  43.42 
 
 		 325 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  38.86 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  36.75 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  35.44 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  35.65 
 
 		 311 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  30.4 
 
 		 452 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0661  hypothetical protein  29.61 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  33.48 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  33.55 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  26.95 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  33.92 
 
 		 340 aa  61.6  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  31.33 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  24.4 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  29.79 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  25.11 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07940  hypothetical protein  29 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  29.51 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  25.75 
 
 		 327 aa  52  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  33.62 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1349  hypothetical protein  24.84 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2434  hypothetical protein  32.99 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.30947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2088  hypothetical protein  27 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0013541  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00710  hypothetical protein  27.81 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2090  hypothetical protein  30.49 
 
 		 218 aa  42  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.862731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>