37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2431 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  654    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  25.07 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  36.36 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  32.28 
 
 
218 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  33.33 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  29.55 
 
 
218 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  24.71 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  24.71 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  31.2 
 
 
195 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  31.58 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2662  hypothetical protein  28.57 
 
 
490 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  25.75 
 
 
229 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  25.23 
 
 
228 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  25.1 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3402  hypothetical protein  31.45 
 
 
217 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.572475  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2658  hypothetical protein  28.65 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  31.62 
 
 
226 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2675  hypothetical protein  28.65 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3044  hypothetical protein  28.14 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2476  hypothetical protein  28.65 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.058907  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5609  hypothetical protein  30.81 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3114  hypothetical protein  31.37 
 
 
252 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692009  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  27.04 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3440  hypothetical protein  30.08 
 
 
190 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.744208  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2090  hypothetical protein  30.85 
 
 
218 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1989  hypothetical protein  30.5 
 
 
251 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193754  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0513  hypothetical protein  45.71 
 
 
507 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  27.81 
 
 
311 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  22.27 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  22.77 
 
 
323 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4984  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0797538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5544  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000271519  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  21.92 
 
 
266 aa  42.4  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5393  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.62077e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5002  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5152  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000285957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>