26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3259 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  44.55 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  36.88 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  36.88 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  37.18 
 
 		 229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  37.29 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  32.73 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  37.94 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  31.27 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  32.22 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  31.7 
 
 		 452 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  27.59 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  30.99 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0661  hypothetical protein  28.88 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  30.36 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  22.26 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3440  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  52.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.744208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1219  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  33.72 
 
 		 2179 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  34.18 
 
 		 2272 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  25.45 
 
 		 228 aa  45.8  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0158  hypothetical protein  26.35 
 
 		 189 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0441  hypothetical protein  35.56 
 
 		 182 aa  45.8  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  26.57 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  37.97 
 
 		 1079 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03740  eukaryotic initiation factor 4F subunit P130, putative  34.09 
 
 		 1203 aa  42.7  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>