30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2146 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  71.1 
 
 		 218 aa  328  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  56.34 
 
 		 225 aa  255  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  56.28 
 
 		 226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  53 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  40.38 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1503  protein of unknown function DUF975  35.94 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  32.89 
 
 		 252 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2424  hypothetical protein  29.96 
 
 		 267 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.129436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  35.57 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  29.77 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  24.5 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  32.12 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  27.4 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  21.21 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0384  hypothetical protein  22.87 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  29.55 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  24.31 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  23.38 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  29.51 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  29.51 
 
 		 317 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  29.51 
 
 		 317 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  27.5 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  29.77 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  26.23 
 
 		 335 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  24.62 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  30.58 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3044  hypothetical protein  29.13 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  25.16 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2194  protein of unknown function DUF975  31.2 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>