22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12581 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  629  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  42.97 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  42.97 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  43.42 
 
 
229 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  40.53 
 
 
335 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  39.37 
 
 
323 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  34.92 
 
 
250 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  33.47 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  29.55 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  32.07 
 
 
452 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  31.92 
 
 
313 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0661  hypothetical protein  26.67 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  30.72 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  30.4 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  26.74 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  28.12 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  33.82 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07940  hypothetical protein  37.14 
 
 
245 aa  47  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  42.03 
 
 
1079 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  24.46 
 
 
252 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  28.57 
 
 
226 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>