31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1792 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  543  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  53 
 
 
218 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  46.54 
 
 
218 aa  217  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  46.45 
 
 
225 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  45.97 
 
 
226 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  36.76 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1503  protein of unknown function DUF975  32.81 
 
 
259 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  26.32 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  31.54 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2424  hypothetical protein  27.72 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.129436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  32.24 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  32.89 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  26.29 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  26.95 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  26.95 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  26.95 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  27.86 
 
 
335 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  28.21 
 
 
195 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  22.61 
 
 
281 aa  58.9  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  21.05 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  20.39 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  27.38 
 
 
323 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0384  hypothetical protein  22.77 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  26.01 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  28.68 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  23.27 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  25.87 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  25 
 
 
200 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0441  hypothetical protein  26.74 
 
 
182 aa  43.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  25.69 
 
 
314 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  21.92 
 
 
327 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>