31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2197 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  30.98 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  30.38 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  33.48 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  30.38 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  31.22 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  27.51 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  28.84 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  29.22 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  26.2 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  30.25 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  26.01 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  28.66 
 
 
340 aa  59.7  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  37.39 
 
 
225 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  39.78 
 
 
2914 aa  53.9  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  30.14 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  30.49 
 
 
327 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  37.5 
 
 
2179 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  34.82 
 
 
218 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  43.56 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  37.84 
 
 
218 aa  50.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  26.86 
 
 
514 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  33.68 
 
 
2272 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  32.14 
 
 
2851 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  35.16 
 
 
1646 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  26.85 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  22.55 
 
 
266 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  48.72 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  35.48 
 
 
985 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>