24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  100 
 
 		 340 aa  640    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  42.72 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  37.33 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  36.43 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  34.5 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  34.5 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  34.38 
 
 		 295 aa  99.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  32.02 
 
 		 250 aa  96.3  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  33.92 
 
 		 229 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  29.55 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  30.59 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  32.4 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0661  hypothetical protein  30.32 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  28.78 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  27.56 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  24.71 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  30.22 
 
 		 514 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  32.08 
 
 		 1646 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  25.44 
 
 		 266 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02743  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A (eIF3a)(Eukaryotic translation initiation factor 3 110 kDa subunit homolog)(eIF3 p110)(Translation initiation factor eIF3, p110 subunit homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9N7]  34.18 
 
 		 1035 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.224701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  27.93 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1198 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  25.31 
 
 		 218 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  45.12 
 
 		 163 aa  42.7  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>