20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1040 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  63.81 
 
 		 265 aa  358  7e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  63.81 
 
 		 265 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1579  membrane protein  44.11 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  32 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  27.84 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2976  hypothetical protein  26.52 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  24.89 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  25.11 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  28.83 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  24 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  21.21 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  22.61 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  24.79 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  21.74 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  23.28 
 
 		 218 aa  52.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  22.27 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1473  hypothetical protein  28.89 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0425  hypothetical membrane spanning protein  22.3 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.800318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1749  hypothetical protein  22.26 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000252365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>