16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2976 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2976  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  26.52 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  27.24 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  26.62 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  26.52 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1579  membrane protein  26.69 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  31.12 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  29.91 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  32.05 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  24.82 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  30.77 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  30.65 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  36.84 
 
 		 195 aa  49.7  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0425  hypothetical membrane spanning protein  24.81 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.800318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1749  hypothetical protein  25.66 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000252365  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  31.01 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>