21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02070 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  100 
 
 		 239 aa  474  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  32.27 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2976  hypothetical protein  30.77 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  25.57 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  32.05 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  29.57 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  31.41 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  29.38 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  25.79 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  33.54 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1579  membrane protein  31.72 
 
 		 269 aa  62  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  26.01 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1749  hypothetical protein  21.34 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000252365  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0425  hypothetical membrane spanning protein  21.24 
 
 		 262 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.800318  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  25 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  28.35 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  25.66 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  21.88 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  26 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  27.15 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>