58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1763 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0026  integral membrane protein  43.23 
 
 
247 aa  194  8.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.667689  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5427  hypothetical protein  38.18 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  34.58 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5100  hypothetical protein  39.23 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4984  hypothetical protein  36.63 
 
 
217 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0797538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5152  hypothetical protein  36.63 
 
 
217 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000285957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5393  hypothetical protein  36.63 
 
 
217 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.62077e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5002  hypothetical protein  36.63 
 
 
217 aa  118  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5544  hypothetical protein  36.63 
 
 
217 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000271519  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1063  integral membrane protein  33.33 
 
 
269 aa  117  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000155002  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5527  integral membrane protein  35.07 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000108543  hitchhiker  0.0000000242358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4213  integral membrane protein  35.65 
 
 
217 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.395001 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5423  integral membrane protein  38.35 
 
 
214 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1989  hypothetical protein  43.2 
 
 
251 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193754  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0528  integral membrane protein  39.46 
 
 
244 aa  102  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2194  protein of unknown function DUF975  34.07 
 
 
216 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3114  hypothetical protein  35.26 
 
 
252 aa  98.2  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2658  hypothetical protein  35.9 
 
 
252 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2675  hypothetical protein  35.9 
 
 
252 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2476  hypothetical protein  35.9 
 
 
252 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.058907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2008  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000169588  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5609  hypothetical protein  35.95 
 
 
252 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23050  predicted integral membrane protein  46.67 
 
 
315 aa  88.6  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5101  hypothetical protein  44.68 
 
 
261 aa  88.2  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5394  hypothetical protein  45.19 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58278e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5545  hypothetical protein  45.19 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000433429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5153  hypothetical protein  45.19 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000141896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5003  group-specific protein  44.23 
 
 
263 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4985  hypothetical protein  45.19 
 
 
263 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0146407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5480  hypothetical protein  44.34 
 
 
264 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5428  hypothetical protein  42.45 
 
 
264 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5424  group-specific protein  30 
 
 
261 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00185358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3044  hypothetical protein  36 
 
 
249 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5526  group-specific protein  28.89 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173284  hitchhiker  0.0000000104917 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3823  hypothetical protein  42.39 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0395  hypothetical protein  36.73 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0101  hypothetical protein  28.63 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000075579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0105  hypothetical protein  26.8 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3822  hypothetical protein  45.56 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0213  hypothetical protein  37.25 
 
 
257 aa  62.4  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5479  integral membrane protein  30.99 
 
 
146 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0315  hypothetical protein  26.64 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.428114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0309  hypothetical protein  26.36 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3083  protein of unknown function DUF975  30.46 
 
 
244 aa  54.7  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2383  protein of unknown function DUF975  47.46 
 
 
228 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0102  hypothetical protein  65.79 
 
 
290 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000170522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  28.82 
 
 
252 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  29.77 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0160  hypothetical protein  22.08 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5478  hypothetical protein  56.41 
 
 
55 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  26.51 
 
 
245 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  29.55 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  22.94 
 
 
225 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  25 
 
 
218 aa  45.1  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  27.63 
 
 
335 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  27.56 
 
 
239 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>