16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1407 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  32 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  29.48 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  29.48 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  32.05 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1579  membrane protein  29.41 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  31.58 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2976  hypothetical protein  24.82 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  27.12 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  23.87 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  23.4 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  28.65 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  23.27 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  25.16 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0425  hypothetical membrane spanning protein  22.78 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.800318  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  21.88 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>