10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1579 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1579  membrane protein  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  47.15 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  46.1 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  44.11 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  29.41 
 
 		 258 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2976  hypothetical protein  26.69 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  27.87 
 
 		 247 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  31.72 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  27.59 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  26.58 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>