15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3402 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3402  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.572475  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2674  hypothetical protein  30.99 
 
 
271 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2090  hypothetical protein  43.37 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  35.29 
 
 
241 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1349  hypothetical protein  42.55 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  28.98 
 
 
294 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0441  membrane protein  29.46 
 
 
226 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  26.16 
 
 
327 aa  51.6  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4960  hypothetical protein  31.43 
 
 
296 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000232988 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  27.98 
 
 
225 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2662  hypothetical protein  26.63 
 
 
490 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  24.54 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  46 
 
 
428 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  28.33 
 
 
360 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  23.39 
 
 
218 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>