More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1369 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
297 aa  597  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.13 
 
 
275 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.1 
 
 
278 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
287 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
296 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
253 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
297 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
293 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
279 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
292 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.76 
 
 
295 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
288 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
299 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
275 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
306 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.76 
 
 
297 aa  161  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
279 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
289 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
277 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
277 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
278 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
280 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  32.5 
 
 
280 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  32.5 
 
 
280 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  32.5 
 
 
280 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  32.5 
 
 
280 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
280 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
305 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
280 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
278 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
280 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
280 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
276 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  31.23 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
281 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
296 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
285 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
280 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
276 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
285 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 
280 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.04 
 
 
275 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
275 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
284 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
276 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
280 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
296 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
277 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
276 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
283 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
281 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
286 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
316 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.216679  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
283 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
281 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.08 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
297 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
280 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
280 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.34 
 
 
277 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
281 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
277 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
274 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
292 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0409709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
282 aa  143  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5072  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
279 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
289 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
282 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
281 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
279 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
282 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
288 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.13 
 
 
319 aa  142  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  31.75 
 
 
275 aa  142  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0830  multiple sugar transport system permease protein  30.65 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  33.11 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
281 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
286 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
274 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>