83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1142 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1142  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  167  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4480  putative transposase  57.89 
 
 
72 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000754165 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  64 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  47.27 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  47.27 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  47.27 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  47.27 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  47.27 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  47.27 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0007  hypothetical protein  64.71 
 
 
136 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  43.55 
 
 
172 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  39.66 
 
 
187 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  40.68 
 
 
342 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  40.68 
 
 
342 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  40.68 
 
 
342 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4750  putative transposase  43.14 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110004  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  40 
 
 
256 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  38.33 
 
 
356 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.56 
 
 
336 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.56 
 
 
336 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.56 
 
 
336 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.56 
 
 
336 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.56 
 
 
336 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.56 
 
 
336 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.56 
 
 
336 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  38.33 
 
 
356 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  42.22 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  42.22 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  42.22 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  42.22 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  38.33 
 
 
356 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  42.22 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  42.22 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  38.18 
 
 
169 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  38.18 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  38.33 
 
 
356 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  36.73 
 
 
178 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  36.73 
 
 
177 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  36.36 
 
 
169 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  36.73 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  36.73 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  36.73 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  36.73 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  36.73 
 
 
177 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  36.73 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.82 
 
 
353 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  40 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.82 
 
 
353 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  42.86 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  41.46 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  36.36 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1028  ISSod10, transposase OrfB  41.46 
 
 
124 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  36.73 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  36.73 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1410  transposase  32.84 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176947  normal  0.221999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4209  hypothetical protein  44.44 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1289  putative transposase, orfB  44.83 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.472193 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0801  hypothetical protein  43.59 
 
 
342 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1138  hypothetical protein  43.59 
 
 
342 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1412  hypothetical protein  43.59 
 
 
342 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1933  hypothetical protein  43.59 
 
 
342 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1965  hypothetical protein  43.59 
 
 
342 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  40 
 
 
178 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2869  hypothetical protein  43.59 
 
 
351 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  40.82 
 
 
294 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  40.82 
 
 
294 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  40.82 
 
 
294 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  40.82 
 
 
294 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  40.82 
 
 
294 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  44.44 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>