149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4480 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4480  putative transposase  100 
 
 		 72 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000754165 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  67.24 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  60 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  60 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  60 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  60.94 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  60.94 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  60.94 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  50 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4750  putative transposase  48.44 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1142  hypothetical protein  57.89 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0007  hypothetical protein  55.56 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  40.98 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  40.98 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  40.98 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  40.98 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  40.98 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  40.98 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  33.87 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  40.3 
 
 		 362 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  44.26 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  33.87 
 
 		 169 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  35.48 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  35.48 
 
 		 177 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  39.34 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  39.34 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  39.34 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  39.34 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  39.34 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  39.34 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  40 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0408  hypothetical protein  59.18 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000382549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  39.34 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  39.34 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00474  transposase  39.34 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  39.34 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  40 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  40 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  40.32 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1289  putative transposase, orfB  40 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.472193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  41.67 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  36.67 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.68 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.68 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.68 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.68 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.68 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  38.71 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.68 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.68 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  41.67 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0371  hypothetical protein  38.1 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  33.33 
 
 		 342 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  33.33 
 
 		 342 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  33.33 
 
 		 342 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1028  ISSod10, transposase OrfB  38.33 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  36.67 
 
 		 294 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  36.67 
 
 		 294 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  36.67 
 
 		 294 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  36.67 
 
 		 294 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  36.67 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>