More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0659 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0659  aminotransferase class-III  100 
 
 
428 aa  885    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1243  aminotransferase class-III  60.09 
 
 
426 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000210523  hitchhiker  0.000012077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5565  aminotransferase class-III  59.62 
 
 
426 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0198  aminotransferase  59.67 
 
 
425 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0207  aminotransferase  59.67 
 
 
425 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0187  aminotransferase  59.91 
 
 
425 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2247  putative aminotransferase  44.42 
 
 
410 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1070  aminotransferase class-III  32.44 
 
 
460 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.79 
 
 
457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  32.57 
 
 
477 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3034  aminotransferase  31.91 
 
 
433 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  31.28 
 
 
411 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  33.58 
 
 
477 aa  187  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  32.41 
 
 
411 aa  186  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  33.42 
 
 
462 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.15 
 
 
472 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.38 
 
 
477 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  34.37 
 
 
457 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.4 
 
 
459 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  31.18 
 
 
475 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.34 
 
 
429 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  29.66 
 
 
475 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  30.71 
 
 
468 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  30.34 
 
 
429 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  34.16 
 
 
463 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.34 
 
 
459 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  30.34 
 
 
459 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.34 
 
 
429 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.34 
 
 
429 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.34 
 
 
429 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  32.04 
 
 
462 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  33.98 
 
 
460 aa  176  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.5 
 
 
477 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  31.67 
 
 
463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.62 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.62 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.62 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.62 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.62 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  30.56 
 
 
472 aa  173  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0117  aminotransferase class-III  30.29 
 
 
421 aa  173  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0673472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  30.62 
 
 
463 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  35.53 
 
 
457 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  31.16 
 
 
463 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.59 
 
 
391 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  31.79 
 
 
463 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  33.33 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1071  aminotransferase class-III  30.58 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  32.56 
 
 
453 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  29.59 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.46 
 
 
397 aa  163  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  30.57 
 
 
463 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  31.35 
 
 
402 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  30.29 
 
 
891 aa  162  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  31.23 
 
 
427 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  28.72 
 
 
398 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  31.51 
 
 
390 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  28.94 
 
 
460 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  28.64 
 
 
396 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  28.64 
 
 
396 aa  160  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  28.16 
 
 
402 aa  159  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.84 
 
 
406 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  30.18 
 
 
401 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.58 
 
 
406 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3279  aminotransferase  29.58 
 
 
401 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  30.42 
 
 
395 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.89 
 
 
406 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  31.07 
 
 
401 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  29.23 
 
 
468 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  29.84 
 
 
389 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.89 
 
 
406 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3433  aminotransferase class-III  30.45 
 
 
379 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.790855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.47 
 
 
398 aa  156  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.32 
 
 
406 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  29.84 
 
 
389 aa  156  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0761  aminotransferase class-III  32.44 
 
 
469 aa  156  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  30.71 
 
 
395 aa  156  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  31.22 
 
 
403 aa  156  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.22 
 
 
393 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  28.97 
 
 
386 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  30.15 
 
 
427 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  28.53 
 
 
423 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  31.53 
 
 
396 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  29.77 
 
 
399 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  31.53 
 
 
396 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  31.53 
 
 
396 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  29.08 
 
 
399 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  29.53 
 
 
392 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  31.53 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  28.4 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  31.19 
 
 
386 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  29.1 
 
 
406 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  34.23 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  29.6 
 
 
386 aa  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  30.39 
 
 
394 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  31.53 
 
 
396 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  30.4 
 
 
422 aa  152  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  31.53 
 
 
396 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  31.27 
 
 
955 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  31.23 
 
 
396 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>