110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5527 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5527  peptidase S15  100 
 
 		 762 aa  1514    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395957  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  31.9 
 
 		 582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3635  peptidase S15  28.67 
 
 		 574 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.958468  normal  0.454344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.95 
 
 		 550 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  25.67 
 
 		 542 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  24.76 
 
 		 547 aa  95.1  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.48 
 
 		 588 aa  94  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  24.6 
 
 		 541 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  24.6 
 
 		 541 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  26.51 
 
 		 595 aa  88.2  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.85 
 
 		 594 aa  85.1  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  22.62 
 
 		 553 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.08 
 
 		 595 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.65 
 
 		 580 aa  77.4  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  21.64 
 
 		 540 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  23.78 
 
 		 679 aa  75.1  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  27.11 
 
 		 576 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.1 
 
 		 577 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  24.61 
 
 		 571 aa  72  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  27.68 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  26.03 
 
 		 711 aa  69.7  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  31.44 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.7 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  27.74 
 
 		 714 aa  67.8  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.77 
 
 		 625 aa  66.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  25.59 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  28.9 
 
 		 674 aa  64.3  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  24.71 
 
 		 677 aa  63.9  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  24.49 
 
 		 677 aa  63.9  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  29.29 
 
 		 503 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  28.1 
 
 		 668 aa  63.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  23.21 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  25.19 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  25.25 
 
 		 670 aa  62.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  23.21 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  23.21 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  25.74 
 
 		 670 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4235  peptidase S15  26.13 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  32.64 
 
 		 650 aa  62.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  26.8 
 
 		 670 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  25.96 
 
 		 667 aa  62.4  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.28 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  32.37 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  28.17 
 
 		 545 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.61 
 
 		 673 aa  60.8  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  26.44 
 
 		 678 aa  60.1  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  23.31 
 
 		 680 aa  59.7  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  25.77 
 
 		 670 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  33.1 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  22.95 
 
 		 663 aa  60.1  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  29.8 
 
 		 667 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  40 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  27.8 
 
 		 549 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  23.8 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  29.29 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  27.67 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.65 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  28.34 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  25.86 
 
 		 705 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  26.57 
 
 		 679 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  22.62 
 
 		 636 aa  56.6  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  24.6 
 
 		 677 aa  56.2  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  26.24 
 
 		 674 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  24.74 
 
 		 615 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.43 
 
 		 647 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  35.85 
 
 		 686 aa  56.6  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  29.52 
 
 		 667 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.65 
 
 		 609 aa  55.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  26.59 
 
 		 690 aa  54.7  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  24.21 
 
 		 668 aa  54.7  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  29.38 
 
 		 668 aa  53.5  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  35.48 
 
 		 537 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.31 
 
 		 629 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  29.52 
 
 		 667 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  27.59 
 
 		 644 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  24.45 
 
 		 598 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.9 
 
 		 599 aa  52.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  38.82 
 
 		 576 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  25.63 
 
 		 571 aa  52.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  20.05 
 
 		 641 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  21.26 
 
 		 545 aa  51.6  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  24.35 
 
 		 612 aa  51.2  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  23.61 
 
 		 668 aa  50.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11239  hypothetical protein  41.03 
 
 		 561 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000144699  normal  0.0575196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  21.46 
 
 		 700 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.15 
 
 		 561 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  24.63 
 
 		 534 aa  48.9  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  33.93 
 
 		 588 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  26.82 
 
 		 665 aa  48.5  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.17 
 
 		 524 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.37 
 
 		 678 aa  48.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  20.98 
 
 		 666 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  30 
 
 		 569 aa  47.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  50 
 
 		 611 aa  47.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  23.93 
 
 		 558 aa  47  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  36.14 
 
 		 599 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.36 
 
 		 568 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2616  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2670  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  19.96 
 
 		 617 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0600255 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>