216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0876 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  100 
 
 		 329 aa  690    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  91.49 
 
 		 329 aa  654    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  90.49 
 
 		 329 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  87.84 
 
 		 329 aa  626  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  79.27 
 
 		 346 aa  567  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  77.13 
 
 		 329 aa  565  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  74.23 
 
 		 327 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  67.89 
 
 		 332 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  64.04 
 
 		 328 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  64.04 
 
 		 328 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  53.44 
 
 		 326 aa  378  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  51.41 
 
 		 336 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  53.44 
 
 		 323 aa  354  8.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  42.59 
 
 		 323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  35.56 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  35.45 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  35.26 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  35.26 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  35.26 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  35.26 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  33.94 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  34.76 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  35.19 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  35.08 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  35.08 
 
 		 320 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  34.78 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  33.33 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  33.95 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  33.95 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  33.95 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  33.64 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  33.64 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  33.95 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  33.94 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  33.95 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  33.64 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  33.23 
 
 		 323 aa  211  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  33.33 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  33.33 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  33.02 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  33.64 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  31.99 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  31.69 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  31.48 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  31.12 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  30.06 
 
 		 386 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  30.56 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  28.06 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  28.15 
 
 		 377 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  28.4 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  29.12 
 
 		 400 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  26.07 
 
 		 327 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  27.84 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  26.09 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  24.92 
 
 		 348 aa  115  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  29.08 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  24.43 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  25.26 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  26.15 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  32.46 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  27.18 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  24.79 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  25.35 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.82 
 
 		 438 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  26.83 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  29.88 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  25.34 
 
 		 388 aa  105  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  24.64 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  24.23 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  24.91 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  24.51 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  30.57 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  27.32 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  22.01 
 
 		 396 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  27.42 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  25.98 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  29.87 
 
 		 312 aa  100  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  22.76 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  23.64 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  27.31 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  28.57 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  23.51 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  25.93 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  23.3 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  23.23 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  25.26 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  23.3 
 
 		 388 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  31.72 
 
 		 333 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  28.15 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  30.86 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  24.15 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  22.83 
 
 		 444 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  23.86 
 
 		 388 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>