212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0814 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 
327 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  76.38 
 
 
329 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  76.69 
 
 
329 aa  544  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  75.69 
 
 
346 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  74.23 
 
 
329 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  75.77 
 
 
329 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  74.23 
 
 
329 aa  521  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  64.72 
 
 
332 aa  454  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  59.94 
 
 
328 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  59.63 
 
 
328 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  54.72 
 
 
326 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  51.4 
 
 
336 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  53.02 
 
 
323 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  40.38 
 
 
323 aa  265  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  34.04 
 
 
325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  32.82 
 
 
325 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  33.64 
 
 
332 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  32.82 
 
 
325 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  32.82 
 
 
325 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  32.82 
 
 
325 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  32.82 
 
 
325 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  32.3 
 
 
325 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  32.2 
 
 
320 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  32.61 
 
 
325 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  32.3 
 
 
325 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  32.3 
 
 
328 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  32.92 
 
 
325 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  31.61 
 
 
323 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  31.61 
 
 
323 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  31.31 
 
 
323 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  31.31 
 
 
323 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  29.88 
 
 
323 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  31 
 
 
323 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  31 
 
 
323 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  31 
 
 
323 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  31 
 
 
323 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  31 
 
 
323 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  30.4 
 
 
325 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  30.4 
 
 
323 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  30.4 
 
 
323 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  30.4 
 
 
323 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  30.4 
 
 
323 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  30.4 
 
 
323 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  30.56 
 
 
323 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  30.25 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  30.4 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  30.4 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  29.32 
 
 
324 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  29.79 
 
 
323 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  32.95 
 
 
323 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  28.17 
 
 
323 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  28.85 
 
 
332 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  25.75 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  29 
 
 
368 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  26.67 
 
 
386 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  26.09 
 
 
327 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  27.99 
 
 
400 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  27.99 
 
 
399 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  27.05 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  24.42 
 
 
377 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  24.29 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  26.41 
 
 
333 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  28.29 
 
 
311 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  26.01 
 
 
332 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  23.78 
 
 
379 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  27.21 
 
 
317 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  23.51 
 
 
348 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  27.51 
 
 
335 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  25.46 
 
 
306 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  25.98 
 
 
385 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.24 
 
 
312 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  27.37 
 
 
315 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  28.29 
 
 
311 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  23.49 
 
 
388 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  23.62 
 
 
345 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  25 
 
 
345 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  22.88 
 
 
396 aa  99.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  24.1 
 
 
388 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  24.12 
 
 
387 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  23.47 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  23.86 
 
 
388 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  24.18 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  23.63 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  25.59 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  26.95 
 
 
388 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  26.76 
 
 
391 aa  96.3  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  23.47 
 
 
387 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  24.13 
 
 
313 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  24.82 
 
 
388 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  24.31 
 
 
394 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  24.85 
 
 
359 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  29.14 
 
 
312 aa  94  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  23.47 
 
 
387 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  31.68 
 
 
363 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  24.15 
 
 
307 aa  93.2  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  23.62 
 
 
342 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  23.59 
 
 
315 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  25.4 
 
 
297 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  23.12 
 
 
381 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  23.27 
 
 
438 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>