217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0845 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 		 390 aa  808    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  75.35 
 
 		 385 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  68.13 
 
 		 379 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  64.71 
 
 		 387 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  64.75 
 
 		 388 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  64.49 
 
 		 388 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  65.01 
 
 		 388 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  64.19 
 
 		 387 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  64.19 
 
 		 387 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  65.01 
 
 		 388 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  65.01 
 
 		 388 aa  511  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  63.64 
 
 		 388 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  63.87 
 
 		 396 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  61.36 
 
 		 388 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  62.27 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  30.18 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  30.92 
 
 		 357 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  28.28 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  26.53 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  25.89 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  26.67 
 
 		 326 aa  109  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  24.79 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  28.76 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  28.48 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  27.59 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  24.79 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  25.94 
 
 		 313 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  26.32 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  26.32 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  26.32 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  26.32 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  26.32 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  26.28 
 
 		 323 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  24.69 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  26.32 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  26.32 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  26.32 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  27.11 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  27.11 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  25.28 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  25 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  24.69 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  24.69 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  25 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  25.36 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  25.31 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  26.5 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  25.85 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  27.42 
 
 		 329 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  25.08 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  24.01 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  25 
 
 		 328 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  25 
 
 		 327 aa  99.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  26.76 
 
 		 329 aa  99.8  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  26.64 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  25.56 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  27.83 
 
 		 312 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  24.29 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  24.83 
 
 		 329 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  26.56 
 
 		 345 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  27.82 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  25.59 
 
 		 327 aa  97.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  27.51 
 
 		 307 aa  97.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  24.27 
 
 		 324 aa  97.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  25.48 
 
 		 325 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  25.82 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  24.04 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  28.78 
 
 		 315 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  23.76 
 
 		 311 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  25.7 
 
 		 325 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  31.12 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  26.25 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  24.92 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  25.07 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  24.84 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  25.48 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  25.48 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  25.48 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  25.48 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  26.6 
 
 		 311 aa  92.8  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  33.33 
 
 		 344 aa  92.8  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  26.03 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  24.52 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  23.55 
 
 		 323 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  23.91 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  24.61 
 
 		 325 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  26.23 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  26.76 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  25.31 
 
 		 329 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  25.3 
 
 		 350 aa  90.1  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  24.37 
 
 		 317 aa  89.7  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  24.86 
 
 		 402 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  22.81 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  22.57 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  22.57 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  21.73 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  24.81 
 
 		 307 aa  86.3  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  32.11 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  24.92 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>