217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0834 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  89.9 
 
 		 396 aa  730    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  86.56 
 
 		 388 aa  703    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  99.22 
 
 		 387 aa  796    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 387 aa  800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  98.45 
 
 		 387 aa  789    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  86.3 
 
 		 388 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  86.56 
 
 		 388 aa  703    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  84.97 
 
 		 388 aa  689    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  86.82 
 
 		 388 aa  704    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  73.2 
 
 		 391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  70.98 
 
 		 388 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  71.35 
 
 		 388 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  69.01 
 
 		 379 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  64.71 
 
 		 390 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  67.03 
 
 		 385 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  27.59 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  28.73 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  27.89 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  28.43 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  27.89 
 
 		 323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  27.04 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  27.89 
 
 		 323 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  27.89 
 
 		 323 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  27.89 
 
 		 323 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  27.89 
 
 		 323 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  27.89 
 
 		 323 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  27.89 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  27.89 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  26.91 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  27.61 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  26.63 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  26.63 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  25.8 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  25.8 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  28.51 
 
 		 325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  28.51 
 
 		 325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  26.63 
 
 		 323 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  25.71 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  28.16 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  25.22 
 
 		 328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  24.59 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  26.06 
 
 		 323 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  26.06 
 
 		 323 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  27.35 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  26.85 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  24.86 
 
 		 325 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  26.46 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  24.92 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  25.5 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25.5 
 
 		 323 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  25.5 
 
 		 323 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  25.88 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  26.37 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  26.32 
 
 		 324 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  26.52 
 
 		 320 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  24.53 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  27.49 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  25.71 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  24.79 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  26.59 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  26.34 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  26.14 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  23.68 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  26.86 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  23.68 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  25.68 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  25.72 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  26.87 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  26.24 
 
 		 328 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  29.47 
 
 		 311 aa  99.8  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  24.38 
 
 		 329 aa  99.8  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  24.12 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  24.44 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  25.36 
 
 		 357 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  26.7 
 
 		 328 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  24.72 
 
 		 333 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  24.79 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  31.87 
 
 		 433 aa  96.3  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  24.29 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  28.11 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  28.27 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  25.09 
 
 		 311 aa  92.8  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.73 
 
 		 438 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  34.64 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  25.46 
 
 		 326 aa  91.3  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.65 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  30.59 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  25.64 
 
 		 348 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  34.38 
 
 		 350 aa  90.9  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  30.56 
 
 		 307 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  33.53 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.75 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  27.51 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  26.98 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  27.51 
 
 		 307 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  27.51 
 
 		 307 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  27.51 
 
 		 307 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  35.09 
 
 		 412 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  25.55 
 
 		 307 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  26.51 
 
 		 433 aa  86.3  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>