217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4050 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  100 
 
 
323 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  73.52 
 
 
323 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  73.52 
 
 
323 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  73.52 
 
 
323 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  73.52 
 
 
323 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  73.52 
 
 
323 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  73.52 
 
 
323 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  72.9 
 
 
323 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  73.52 
 
 
323 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  73.52 
 
 
323 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  72.45 
 
 
323 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  71.96 
 
 
323 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  71.96 
 
 
323 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  71.21 
 
 
323 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  71.34 
 
 
323 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  71.65 
 
 
323 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  71.65 
 
 
323 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  70.72 
 
 
323 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  70.72 
 
 
323 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  70.4 
 
 
323 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  68.42 
 
 
323 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  67.39 
 
 
323 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  67.19 
 
 
325 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  67.3 
 
 
320 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  67.5 
 
 
325 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  65.62 
 
 
325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  65.62 
 
 
325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  66.67 
 
 
328 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  65.31 
 
 
325 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  65.62 
 
 
325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  65.62 
 
 
325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  64.06 
 
 
325 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  65.83 
 
 
325 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  63.75 
 
 
325 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  61.88 
 
 
325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  61.49 
 
 
324 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  58.57 
 
 
332 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  38.51 
 
 
323 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  33.75 
 
 
332 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  34.49 
 
 
328 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  34.18 
 
 
328 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  37.54 
 
 
357 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  35.33 
 
 
336 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  31.48 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  31.48 
 
 
329 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  36.05 
 
 
346 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  31.66 
 
 
326 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  30.96 
 
 
329 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  30.03 
 
 
329 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  34.5 
 
 
329 aa  185  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  32.38 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  32.95 
 
 
327 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  32.26 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  33.23 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  29.79 
 
 
386 aa  159  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  29.26 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  31 
 
 
311 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  32.12 
 
 
327 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  32.41 
 
 
307 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  29.15 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.14 
 
 
312 aa  136  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  33.71 
 
 
338 aa  136  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  28.52 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  30.64 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  29.01 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  27.84 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.43 
 
 
387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  29.81 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  30.23 
 
 
402 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  28.43 
 
 
387 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  29.37 
 
 
388 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  31.71 
 
 
332 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  32.01 
 
 
355 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  29.45 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  29.07 
 
 
388 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  28.75 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  29.39 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  28.75 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  28.29 
 
 
388 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  26.67 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  28.43 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  29.85 
 
 
400 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  27.3 
 
 
399 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  27.48 
 
 
387 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  27.3 
 
 
433 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  26.56 
 
 
391 aa  122  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.27 
 
 
602 aa  121  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.13 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.94 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  28.31 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  30.04 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  26.72 
 
 
444 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  32.67 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  27.88 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  27.11 
 
 
394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  26.16 
 
 
381 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  27.71 
 
 
419 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  29.89 
 
 
433 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  27.76 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  26.71 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>