216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1454 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  680    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  43.67 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  38.51 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  37.9 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  35.02 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  32.14 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  30.57 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  32 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  28.36 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  27.6 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  28.44 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  28.32 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  28.32 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  27.64 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  29.96 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  27.74 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  26.96 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  31.42 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  29.53 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  27.27 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  26.28 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  26.28 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  27.6 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  27.6 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  27.6 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  27.6 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  32.65 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  27.6 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  26.64 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  26.28 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  33.71 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25.94 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  25.94 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  27.6 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  27.6 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  25.94 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  28.62 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  27.62 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  26.16 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  26.79 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  27.7 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  24.1 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  25.85 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  36.14 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  26.19 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  26.19 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  26.19 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  27.63 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  26.19 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  25.09 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  26.67 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  33.06 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  27.34 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  28.78 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.21 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  26.53 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  26.87 
 
 		 388 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  26.53 
 
 		 388 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  26.53 
 
 		 388 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  26.67 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  35.29 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  28.11 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  27.74 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  35.2 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  26.27 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  27.55 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  37.36 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  26.19 
 
 		 325 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  31.68 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  25.36 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  33.53 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  25.88 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  27.5 
 
 		 328 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  28.42 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  27.76 
 
 		 388 aa  106  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  24.64 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  28.46 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  27.21 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  32.94 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  27.99 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  25 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  26.48 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  34.12 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  25.61 
 
 		 438 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.06 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  34.12 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  34.12 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  34.12 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 		 387 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  23.6 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  30.41 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  34.12 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  32.94 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  37.34 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  24.65 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  23.76 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  26.39 
 
 		 602 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  26.07 
 
 		 385 aa  99.4  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>