218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3733 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  100 
 
 		 323 aa  666    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  42.59 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  42.59 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  42.81 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  43.49 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  42.86 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  41.05 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  39.51 
 
 		 329 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  40.87 
 
 		 326 aa  269  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  40.68 
 
 		 332 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  40.38 
 
 		 327 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  38.51 
 
 		 329 aa  265  7e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  40.75 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  40.81 
 
 		 323 aa  255  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  40.5 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  40.5 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  38.94 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  40.19 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  40.19 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  40.19 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  40.19 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  40.19 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  39.88 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  38.39 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  37.77 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  38.32 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  38.01 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  38.01 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  38.01 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  38.32 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  37.69 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  37.38 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  37.38 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  37.38 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  38.51 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  39.13 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  38.2 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  36.25 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  37.38 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  35.51 
 
 		 325 aa  225  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  34.89 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  35.51 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  35.51 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  35.51 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  35.51 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  35.94 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  34.89 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  34.58 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  34.89 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  34.27 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  36.96 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  32.12 
 
 		 368 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  33.96 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  30.54 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  34.3 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  33.67 
 
 		 400 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  32.19 
 
 		 399 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  32.8 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  32.57 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  32.14 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  29.18 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.59 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  29.47 
 
 		 438 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  32.34 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  37.44 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  30.82 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  28.85 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  33.94 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  26.57 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  28.09 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  28.7 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  32.19 
 
 		 433 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  33.07 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  28.71 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  27.81 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  28.75 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  28.52 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  34.87 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  30.07 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  30.4 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  32.75 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  28.21 
 
 		 444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  27.91 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  31.05 
 
 		 345 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  30.77 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  29.02 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  28.17 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  29.46 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  28.36 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  29.43 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  38.07 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  34 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  29.36 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.47 
 
 		 387 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  30.26 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 		 433 aa  106  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  29.48 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  26.14 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.55 
 
 		 602 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  26.47 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>