217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4821 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  93.81 
 
 
323 aa  634    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  100 
 
 
323 aa  670    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  93.81 
 
 
323 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  93.81 
 
 
323 aa  634    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  93.81 
 
 
323 aa  634    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  93.81 
 
 
323 aa  634    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  93.5 
 
 
323 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  93.5 
 
 
323 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  92.26 
 
 
323 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  91.02 
 
 
323 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  91.02 
 
 
323 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  90.71 
 
 
323 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  90.71 
 
 
323 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  90.71 
 
 
323 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  90.71 
 
 
323 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  90.09 
 
 
323 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  90.71 
 
 
323 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  85.05 
 
 
323 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  84.42 
 
 
323 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  79.75 
 
 
323 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  78.19 
 
 
323 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  72.9 
 
 
323 aa  508  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  69.75 
 
 
325 aa  487  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  69.44 
 
 
325 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  69.44 
 
 
325 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  69.75 
 
 
325 aa  487  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  69.44 
 
 
325 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  69.75 
 
 
325 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  69.28 
 
 
320 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  69.75 
 
 
325 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  68.52 
 
 
325 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  69.91 
 
 
328 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  67.9 
 
 
325 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  68.75 
 
 
325 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  67.6 
 
 
325 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  62.65 
 
 
324 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  58.07 
 
 
332 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  39.88 
 
 
323 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  35.08 
 
 
332 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  34.25 
 
 
328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  34.16 
 
 
328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  33.64 
 
 
329 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  31.82 
 
 
329 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  31.52 
 
 
329 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  34.26 
 
 
336 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  31.21 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  35.48 
 
 
357 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  34.83 
 
 
377 aa  188  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  31.15 
 
 
326 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  29.94 
 
 
329 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  29.79 
 
 
327 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  29.79 
 
 
346 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  31.15 
 
 
323 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  30.81 
 
 
368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  31.8 
 
 
327 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  29.82 
 
 
386 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31 
 
 
311 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  29.45 
 
 
328 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  35.05 
 
 
332 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  34.48 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  30.69 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.67 
 
 
348 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  29.87 
 
 
338 aa  139  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  29.21 
 
 
402 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.85 
 
 
602 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  30.92 
 
 
355 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.35 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  30.04 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  28.57 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  27.4 
 
 
315 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  26.12 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  26.35 
 
 
433 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  28.45 
 
 
379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  26.91 
 
 
399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  29.08 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  27.02 
 
 
335 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.16 
 
 
438 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  27.74 
 
 
329 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  28.35 
 
 
326 aa  123  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  31.71 
 
 
350 aa  123  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  27.64 
 
 
400 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  25.28 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  31.29 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  25.37 
 
 
333 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.91 
 
 
387 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  26.91 
 
 
387 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  26.32 
 
 
429 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  26.35 
 
 
419 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  27.27 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  27.87 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  26.97 
 
 
388 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  26.7 
 
 
388 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  26.84 
 
 
388 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  26.69 
 
 
388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  30.56 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  25.15 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  27.63 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  25.37 
 
 
444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  25.87 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  25.55 
 
 
396 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>