215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3107 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 		 385 aa  796    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  73.01 
 
 		 390 aa  587  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  69.74 
 
 		 379 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  65.45 
 
 		 387 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  65.97 
 
 		 387 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  65.71 
 
 		 387 aa  518  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  64.54 
 
 		 388 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  66.32 
 
 		 388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  64.36 
 
 		 388 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  64.1 
 
 		 388 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  64.8 
 
 		 388 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  63.97 
 
 		 391 aa  511  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  63.2 
 
 		 396 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  63.12 
 
 		 388 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  62.2 
 
 		 388 aa  494  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  26.38 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  30 
 
 		 357 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  27.94 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  28.9 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  28.85 
 
 		 325 aa  121  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  27.88 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  25.55 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  26.63 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  26.62 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  28.17 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  28.17 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  28.17 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  28.17 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  28.17 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  26.62 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  26.63 
 
 		 323 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  25.55 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  27.6 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25.55 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  25.55 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  25.55 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  28.17 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  28.17 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  25.15 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  25.24 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  25.24 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  25.28 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  28.28 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  25.78 
 
 		 323 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  28.57 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  26.44 
 
 		 329 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  26.15 
 
 		 329 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  26.44 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  29.02 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  27.22 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  30.48 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  29.37 
 
 		 433 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  26.27 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  24.76 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  26.16 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  26.27 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  26.33 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  25.88 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  28.32 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  30.2 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  25.99 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  26.86 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  25.88 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  26.54 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  25.35 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  25.99 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  25.71 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  25.99 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  25.99 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  26.09 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  26.5 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  26.02 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  31.77 
 
 		 307 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  25.96 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  24.63 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  24.5 
 
 		 329 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.24 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  25.94 
 
 		 325 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  26.07 
 
 		 329 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  23.99 
 
 		 311 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  26.48 
 
 		 332 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.43 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  24.13 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  25.08 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  26.74 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  28.1 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  27.15 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  25.33 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  32.18 
 
 		 223 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  23.39 
 
 		 326 aa  91.3  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  26.46 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  26.16 
 
 		 345 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  23.96 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  36.16 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  26.54 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  29.84 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  27.21 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  23.22 
 
 		 333 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  24.92 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  28.9 
 
 		 306 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>