216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3437 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  100 
 
 
323 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  92.24 
 
 
323 aa  627  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  86.6 
 
 
323 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  85.36 
 
 
323 aa  591  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  79.13 
 
 
323 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  79.13 
 
 
323 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  79.13 
 
 
323 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  79.13 
 
 
323 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  79.13 
 
 
323 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  78.82 
 
 
323 aa  544  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  78.82 
 
 
323 aa  544  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  79.13 
 
 
323 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  78.19 
 
 
323 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  76.64 
 
 
323 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  76.64 
 
 
323 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  76.32 
 
 
323 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  76.64 
 
 
323 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  76.64 
 
 
323 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  76.32 
 
 
323 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  76.01 
 
 
323 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  75.39 
 
 
323 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  67.39 
 
 
323 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  65.52 
 
 
325 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  65.41 
 
 
320 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  65.41 
 
 
325 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  65.83 
 
 
328 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  64.78 
 
 
325 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  65.09 
 
 
325 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  64.15 
 
 
325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  64.15 
 
 
325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  64.15 
 
 
325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  64.15 
 
 
325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  63.52 
 
 
325 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  62.89 
 
 
325 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  60.62 
 
 
325 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  60.56 
 
 
324 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  54.83 
 
 
332 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  38.32 
 
 
323 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  35.08 
 
 
332 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  33.96 
 
 
328 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  33.96 
 
 
328 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  35.31 
 
 
336 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  31.69 
 
 
329 aa  201  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  30.15 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  30.46 
 
 
329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  30.82 
 
 
326 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  34.44 
 
 
377 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  30.34 
 
 
346 aa  192  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  29.54 
 
 
329 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  30.34 
 
 
329 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  33.82 
 
 
386 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  33.53 
 
 
368 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  28.17 
 
 
327 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  31.33 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  32.55 
 
 
357 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.34 
 
 
311 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  34.1 
 
 
332 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  30.36 
 
 
327 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  29.3 
 
 
402 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.22 
 
 
312 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  29.87 
 
 
338 aa  139  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  32.64 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  32.07 
 
 
332 aa  136  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  28.4 
 
 
433 aa  135  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  28 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  27.54 
 
 
328 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  25.69 
 
 
348 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  27.7 
 
 
311 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  28.01 
 
 
335 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  32.58 
 
 
333 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  30.36 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  28.12 
 
 
438 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  29.26 
 
 
602 aa  128  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  28.01 
 
 
315 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  29.5 
 
 
326 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  28.24 
 
 
394 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  25.5 
 
 
412 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  27.04 
 
 
387 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  25.61 
 
 
317 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  26.76 
 
 
396 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  28.68 
 
 
342 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.76 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  24.71 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  30 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  26.65 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  27.3 
 
 
444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  24.21 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  27.3 
 
 
433 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  35.23 
 
 
307 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  27.63 
 
 
388 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  28.34 
 
 
415 aa  115  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  26.25 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  27.39 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  25 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  25.92 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  27.39 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  27.06 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  33.68 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  25.43 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  25.91 
 
 
412 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>