214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3840 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 
335 aa  683    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  43.67 
 
 
329 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  39.88 
 
 
333 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  34.1 
 
 
332 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  34.64 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  37.5 
 
 
327 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  28.57 
 
 
323 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  28.25 
 
 
323 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  28.25 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.25 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  28.01 
 
 
323 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  32.25 
 
 
325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  29.45 
 
 
323 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  28.38 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  31.37 
 
 
325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  27.02 
 
 
323 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  29.02 
 
 
328 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  31.94 
 
 
325 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  31.94 
 
 
320 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  34.33 
 
 
400 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  28.52 
 
 
324 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  29.02 
 
 
328 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  28.05 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  28.05 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  28.05 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  28.05 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  33.49 
 
 
311 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  28.05 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  28.05 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  28.05 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  29.78 
 
 
325 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  26.73 
 
 
323 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  29.81 
 
 
325 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  26.4 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  26.4 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  30.2 
 
 
325 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  29.41 
 
 
325 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  29.41 
 
 
325 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  26.4 
 
 
323 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  26.4 
 
 
323 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  30.2 
 
 
325 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  26.4 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  28.75 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  26.07 
 
 
323 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  27.47 
 
 
368 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  30.35 
 
 
325 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  26.09 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  30.2 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  25.74 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  29.55 
 
 
328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  31.34 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.92 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  33.2 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  27.42 
 
 
332 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  26.23 
 
 
326 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  37.21 
 
 
307 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  24.93 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  24.64 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  25.76 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  27.33 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  28.85 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  30.54 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  26.69 
 
 
381 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  32.57 
 
 
399 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  29.06 
 
 
332 aa  109  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  28.35 
 
 
444 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  30.41 
 
 
307 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  29.81 
 
 
329 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  27.18 
 
 
336 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.27 
 
 
312 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  27.51 
 
 
327 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  30.13 
 
 
415 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  30.93 
 
 
306 aa  103  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  28.57 
 
 
315 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  30.35 
 
 
602 aa  102  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  26.47 
 
 
399 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  28.33 
 
 
399 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  26.98 
 
 
328 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  24.41 
 
 
313 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  28.63 
 
 
311 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  28.5 
 
 
297 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  28.7 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  29.72 
 
 
379 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  26.65 
 
 
377 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  29.06 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  28.85 
 
 
444 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  32.95 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  26.3 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  32.34 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  29.03 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  39.26 
 
 
412 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  22.36 
 
 
348 aa  96.3  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  28.39 
 
 
402 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  28.02 
 
 
333 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  34.44 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  27.33 
 
 
419 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  28.22 
 
 
345 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  25.89 
 
 
409 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  27.88 
 
 
420 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  35.48 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>