216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5836 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  100 
 
 
444 aa  897    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  61.94 
 
 
399 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  52.31 
 
 
399 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  45.76 
 
 
444 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  41.53 
 
 
402 aa  249  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  41.29 
 
 
394 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  38.07 
 
 
438 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  39.53 
 
 
433 aa  237  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  42.29 
 
 
390 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  41.3 
 
 
419 aa  231  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  37.96 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  37.79 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  35.89 
 
 
433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  39.12 
 
 
388 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  34.67 
 
 
381 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  39.55 
 
 
363 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  36.72 
 
 
402 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  39.78 
 
 
412 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  33.85 
 
 
602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  33.09 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  38.62 
 
 
418 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  37.83 
 
 
412 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.58 
 
 
311 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  37.11 
 
 
392 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  31.25 
 
 
315 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  33.33 
 
 
431 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  35.96 
 
 
405 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  31.62 
 
 
333 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  32.05 
 
 
312 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  34.22 
 
 
350 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  33.94 
 
 
413 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  32.9 
 
 
449 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  32.89 
 
 
415 aa  170  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  32.7 
 
 
428 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  31.88 
 
 
338 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  32.91 
 
 
419 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  30.14 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  30.47 
 
 
307 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  32.85 
 
 
409 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  29.12 
 
 
313 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  31.76 
 
 
412 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  27.01 
 
 
464 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  27.49 
 
 
447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  28.73 
 
 
320 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  30.77 
 
 
315 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  29.19 
 
 
328 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  29.25 
 
 
448 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  27.14 
 
 
472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  28.71 
 
 
448 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  29.25 
 
 
355 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  29.25 
 
 
450 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  28.45 
 
 
320 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  29.18 
 
 
462 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.51 
 
 
348 aa  144  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  31.03 
 
 
355 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  28.84 
 
 
448 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  29.53 
 
 
345 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  29.02 
 
 
353 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  27.66 
 
 
456 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  29.53 
 
 
360 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  31.64 
 
 
444 aa  137  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  26.99 
 
 
352 aa  136  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  29.53 
 
 
345 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  28.97 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  28.46 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  27.32 
 
 
423 aa  133  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  27.76 
 
 
344 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  28.91 
 
 
350 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  26.74 
 
 
342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  29.21 
 
 
359 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  30.77 
 
 
357 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  27.81 
 
 
297 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  28.97 
 
 
307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  27.25 
 
 
355 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  27.36 
 
 
355 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  27.47 
 
 
355 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  28.07 
 
 
342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  26.05 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  30.1 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  30.25 
 
 
342 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  26.58 
 
 
346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  27.54 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  28.57 
 
 
349 aa  116  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  28.57 
 
 
349 aa  116  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  26.69 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  29.28 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  27.62 
 
 
325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  27.51 
 
 
325 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  27.51 
 
 
325 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  27.79 
 
 
325 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  29.37 
 
 
323 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  27.51 
 
 
325 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  26.69 
 
 
325 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  27.51 
 
 
325 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  26.87 
 
 
307 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  26.05 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  27.79 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  26.55 
 
 
354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  27.38 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  28.15 
 
 
394 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>