215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  100 
 
 
423 aa  864    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  65.71 
 
 
464 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  67.08 
 
 
447 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  67.99 
 
 
448 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  67.25 
 
 
448 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  63.28 
 
 
462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  64.84 
 
 
456 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  64.84 
 
 
450 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  64.84 
 
 
472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  64.5 
 
 
448 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  47.89 
 
 
431 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  36.79 
 
 
428 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  35.89 
 
 
402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  31.31 
 
 
439 aa  205  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  32.76 
 
 
338 aa  189  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  34.98 
 
 
350 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  32.41 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  32.27 
 
 
399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  30.81 
 
 
405 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  29.38 
 
 
409 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  35.89 
 
 
412 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  31.71 
 
 
392 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  31.13 
 
 
381 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  31.75 
 
 
444 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  27.63 
 
 
399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  29.58 
 
 
429 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  35.62 
 
 
418 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  35.27 
 
 
412 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  28.19 
 
 
412 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  27.34 
 
 
444 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  28.48 
 
 
419 aa  130  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  28.37 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  26.33 
 
 
438 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  27.49 
 
 
394 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  25.32 
 
 
317 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  25.25 
 
 
602 aa  113  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  27.29 
 
 
433 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  25.12 
 
 
388 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  27.1 
 
 
390 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  24.39 
 
 
348 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  25.62 
 
 
346 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  26.78 
 
 
346 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  26.78 
 
 
346 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  26.43 
 
 
420 aa  103  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  26.48 
 
 
433 aa  103  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  26.78 
 
 
363 aa  103  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  23.76 
 
 
415 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  27.03 
 
 
444 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  27.1 
 
 
327 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  25.82 
 
 
352 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  26.67 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  27.86 
 
 
353 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  28.76 
 
 
352 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  26.09 
 
 
344 aa  96.7  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  27.09 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  26.07 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  36.02 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  27.51 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  31.96 
 
 
333 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  24.94 
 
 
313 aa  89.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  26.14 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  25.86 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  27.08 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  24.76 
 
 
349 aa  87.8  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  24.76 
 
 
349 aa  87.8  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  24.04 
 
 
355 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  24.3 
 
 
307 aa  86.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  22.02 
 
 
325 aa  86.7  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  27.42 
 
 
345 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  25.77 
 
 
360 aa  86.3  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  24.54 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  26.21 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  23 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  23.16 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  32.72 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  25.68 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  23.8 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  23 
 
 
323 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  23.8 
 
 
355 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  25.84 
 
 
325 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  25.53 
 
 
342 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  30.53 
 
 
337 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.18 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  22.19 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  23 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  24.74 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  23 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  24.2 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  23 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  22.87 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  21.88 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  28.07 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  27.09 
 
 
400 aa  79.7  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  22.04 
 
 
323 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  21.81 
 
 
325 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  24.26 
 
 
355 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  22.36 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  24.75 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  22.36 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  26.33 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>