215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3785 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  79.19 
 
 		 462 aa  733    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  74.44 
 
 		 447 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  74.77 
 
 		 464 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  71.27 
 
 		 456 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  70.25 
 
 		 448 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  69.04 
 
 		 450 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 		 448 aa  914    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  70.47 
 
 		 448 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  88.12 
 
 		 472 aa  791    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  64.5 
 
 		 423 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  45.27 
 
 		 431 aa  340  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  35.32 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  32.45 
 
 		 402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  30.83 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  30.02 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  32.99 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  32.52 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  31.85 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  32.23 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  28.44 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  29.62 
 
 		 409 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  31.11 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  26.82 
 
 		 602 aa  154  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  31.14 
 
 		 392 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  28.34 
 
 		 381 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  29.18 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  28.33 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  26.54 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  32.05 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  32.91 
 
 		 418 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  29.85 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  33.78 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  28.66 
 
 		 394 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  22.03 
 
 		 317 aa  118  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  28.12 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  25.13 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 		 433 aa  113  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.57 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  28.61 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  26.79 
 
 		 344 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  24.35 
 
 		 438 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  25.5 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  27.17 
 
 		 420 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  26.3 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  26.23 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  27.6 
 
 		 352 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  26.25 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  27.09 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  28.07 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  27.21 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  24.89 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  25.69 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  25 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  27.33 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  24.08 
 
 		 388 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  25.13 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  30.23 
 
 		 346 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  26.35 
 
 		 353 aa  96.7  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  26.44 
 
 		 363 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  24.19 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  26.87 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  23.53 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  24.19 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  24.19 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  24.19 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  24.19 
 
 		 323 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  32.72 
 
 		 327 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  24.24 
 
 		 313 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  27.86 
 
 		 349 aa  90.5  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  25.6 
 
 		 360 aa  90.1  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  27.93 
 
 		 350 aa  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  24.52 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  27.09 
 
 		 311 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  23.55 
 
 		 323 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  23.55 
 
 		 323 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  25.15 
 
 		 355 aa  87.8  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  24.84 
 
 		 315 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  23.62 
 
 		 323 aa  86.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  23.24 
 
 		 325 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  27.36 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  22.29 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  22.29 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  22.29 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  22.29 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  22.29 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  31.25 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  31.25 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  26.09 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  22.29 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  22.29 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  23.48 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  23.74 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  24.01 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  26.09 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  33.96 
 
 		 327 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  23.95 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  23.42 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  22.19 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  23.4 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  22.9 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>