217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4032 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  100 
 
 
413 aa  837    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  63.38 
 
 
444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  47.63 
 
 
409 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  50.62 
 
 
412 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  50.64 
 
 
405 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  50 
 
 
449 aa  355  5.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  40.37 
 
 
402 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  39.56 
 
 
392 aa  272  8.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  38.34 
 
 
444 aa  224  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  35.05 
 
 
428 aa  210  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  34.39 
 
 
431 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  31.92 
 
 
439 aa  206  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  31.91 
 
 
399 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  35.42 
 
 
394 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  34.57 
 
 
399 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  30.97 
 
 
602 aa  186  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  32.94 
 
 
438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  35.01 
 
 
444 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  29.71 
 
 
464 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  31.08 
 
 
462 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  29.24 
 
 
450 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  29.71 
 
 
447 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  29.33 
 
 
456 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  30.43 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  30.5 
 
 
420 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  31.23 
 
 
433 aa  156  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  29.85 
 
 
448 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  29.2 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  28.37 
 
 
423 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  29.17 
 
 
429 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  31.45 
 
 
350 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  27.88 
 
 
448 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  27.74 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 
433 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  30.53 
 
 
388 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  31.83 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  31.07 
 
 
363 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  27.47 
 
 
328 aa  136  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  28.78 
 
 
415 aa  136  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  29.94 
 
 
390 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  31.36 
 
 
412 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  30.57 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  27.87 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  27.07 
 
 
419 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  28.76 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  25.97 
 
 
311 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  27.06 
 
 
333 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  28.37 
 
 
419 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  25.47 
 
 
311 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  24.79 
 
 
315 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  28.85 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  29.29 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  25.61 
 
 
313 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  26.43 
 
 
348 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  26.75 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  26.81 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  24.8 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  27.01 
 
 
344 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  26.07 
 
 
345 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  25.83 
 
 
311 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  28.37 
 
 
326 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  23.4 
 
 
320 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  27.33 
 
 
355 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  29.28 
 
 
389 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  27.33 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  27.11 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  25.81 
 
 
329 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  27.4 
 
 
388 aa  97.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.27 
 
 
345 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  29.6 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  26.01 
 
 
327 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  29.85 
 
 
362 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  25.23 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  28.41 
 
 
394 aa  94.4  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  25.98 
 
 
352 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  22.71 
 
 
320 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  25.98 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  27.27 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  25.69 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  24.64 
 
 
315 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  28.15 
 
 
397 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  27.76 
 
 
306 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  22.06 
 
 
317 aa  90.9  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2576  peptidase M19, renal dipeptidase  27.65 
 
 
344 aa  90.5  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  21.14 
 
 
323 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  27.35 
 
 
352 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  25.4 
 
 
337 aa  90.1  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  22.12 
 
 
323 aa  89.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  27.15 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  25.24 
 
 
297 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  27.35 
 
 
353 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  26.89 
 
 
342 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  25.44 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  22.12 
 
 
323 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  24.14 
 
 
355 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  22.12 
 
 
323 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  26.57 
 
 
368 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  28.27 
 
 
349 aa  86.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  28.27 
 
 
349 aa  86.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  28.03 
 
 
379 aa  86.7  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>