217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3261 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 
394 aa  796    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  69.15 
 
 
393 aa  543  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  50.26 
 
 
388 aa  362  6e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  48.5 
 
 
387 aa  362  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  48.57 
 
 
390 aa  352  8e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  45.96 
 
 
397 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  52.19 
 
 
389 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3395  peptidase M19, renal dipeptidase  48.5 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0282  peptidase M19, renal dipeptidase  47.12 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00197146  normal  0.781669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  44.81 
 
 
393 aa  295  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  50.73 
 
 
223 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  33.06 
 
 
333 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  28.95 
 
 
311 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  32.16 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  34.17 
 
 
315 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  32.54 
 
 
307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  30.58 
 
 
355 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  30.36 
 
 
444 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  28.65 
 
 
315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  29.06 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  30.75 
 
 
602 aa  126  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  28.32 
 
 
311 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  30 
 
 
328 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  26.74 
 
 
320 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  27.14 
 
 
312 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  31.12 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  26.71 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  30.38 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  31.42 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  33.33 
 
 
306 aa  113  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  28.69 
 
 
360 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  24.18 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  29.86 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  32.88 
 
 
307 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  32 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  29.12 
 
 
338 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  28.45 
 
 
362 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  27.86 
 
 
444 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  26.6 
 
 
429 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  27.86 
 
 
355 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  28.18 
 
 
345 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  26.19 
 
 
348 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  30.56 
 
 
326 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  28.96 
 
 
342 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  26.51 
 
 
354 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  27.83 
 
 
297 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  26.46 
 
 
419 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  25.19 
 
 
399 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  27.76 
 
 
312 aa  99.8  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  30 
 
 
399 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  31.51 
 
 
332 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  26.88 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  33.16 
 
 
324 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  26.49 
 
 
346 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.08 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  29.59 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  30.63 
 
 
310 aa  97.1  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  23.27 
 
 
409 aa  96.7  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  33.04 
 
 
327 aa  96.3  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  25.59 
 
 
433 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  26.2 
 
 
307 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  28.57 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  35.26 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  27.1 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  24.62 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  37.06 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  27.05 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  25.4 
 
 
412 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  28.27 
 
 
307 aa  93.2  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  36.79 
 
 
315 aa  92.8  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  24.79 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  26.89 
 
 
352 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  29.13 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  30.81 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  24.79 
 
 
346 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1025  peptidase M19 renal dipeptidase  27.35 
 
 
356 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134164  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  26.24 
 
 
323 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  25.95 
 
 
323 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  26.24 
 
 
323 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25.95 
 
 
323 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  25.95 
 
 
323 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  26.24 
 
 
323 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  26.24 
 
 
323 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  26.24 
 
 
323 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  26.24 
 
 
323 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  26.24 
 
 
323 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  24.38 
 
 
449 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  30.56 
 
 
310 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  25.5 
 
 
323 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  30.73 
 
 
353 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  25.19 
 
 
381 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  25.48 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  28.36 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  25.5 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  25.5 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  35.2 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  25.5 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  24.4 
 
 
323 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  25.1 
 
 
323 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  26.11 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>