217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3505 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 
327 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2576  peptidase M19, renal dipeptidase  53.11 
 
 
344 aa  299  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  49.38 
 
 
324 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  32.05 
 
 
311 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  34.94 
 
 
333 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  31.49 
 
 
313 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  32.74 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  31.11 
 
 
315 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  34.74 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.35 
 
 
312 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  26.9 
 
 
328 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  28.83 
 
 
307 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  26.9 
 
 
311 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  26.92 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  32.96 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  31.05 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  33.22 
 
 
315 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  32.28 
 
 
345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  29.91 
 
 
444 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  25.99 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  26.45 
 
 
307 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  27.86 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  26.45 
 
 
307 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  25 
 
 
307 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  33.5 
 
 
355 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  31.34 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  28.43 
 
 
307 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  25.81 
 
 
307 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  25.81 
 
 
307 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  25.81 
 
 
307 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  25.81 
 
 
307 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  28.78 
 
 
360 aa  109  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  27.13 
 
 
362 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  29.25 
 
 
344 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  32.14 
 
 
345 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  33.45 
 
 
337 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  27.17 
 
 
307 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  26.36 
 
 
402 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  25.16 
 
 
326 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  38.95 
 
 
344 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  28.65 
 
 
297 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  28.88 
 
 
342 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0326  peptidase M19 renal dipeptidase  33.21 
 
 
323 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  29.32 
 
 
602 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6999  peptidase M19 renal dipeptidase  28.33 
 
 
356 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.584329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  33.05 
 
 
354 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  30.26 
 
 
311 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  34.07 
 
 
338 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  26.37 
 
 
315 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  37.21 
 
 
353 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  28.11 
 
 
415 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2534  peptidase M19 renal dipeptidase  29.91 
 
 
331 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  32.22 
 
 
387 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  34.25 
 
 
350 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  27.05 
 
 
399 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  34.02 
 
 
352 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  26.23 
 
 
323 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  26.09 
 
 
381 aa  99.4  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  37.42 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  28.05 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  26.19 
 
 
346 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  25.5 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  33.33 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  37.65 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  27.87 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  27.49 
 
 
429 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  24.76 
 
 
320 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  30.87 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  33.04 
 
 
394 aa  96.3  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  24.61 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  24.92 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1112  peptidase M19, renal dipeptidase  33.44 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0274447  hitchhiker  0.0050668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  24.17 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  27.83 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1025  peptidase M19 renal dipeptidase  30.08 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134164  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  27.63 
 
 
346 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  26.94 
 
 
363 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0672  peptidase M19, renal dipeptidase  28.44 
 
 
356 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  28.79 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  31.67 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  31.67 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  30.43 
 
 
327 aa  92.8  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  27.63 
 
 
346 aa  93.2  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  26.24 
 
 
394 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  34.48 
 
 
342 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  35.58 
 
 
352 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  29.39 
 
 
323 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  30.09 
 
 
223 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  32.51 
 
 
431 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  27.51 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  26.63 
 
 
444 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  28.4 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  27.65 
 
 
323 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  24.5 
 
 
323 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  25.28 
 
 
433 aa  89.7  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  28.03 
 
 
323 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  28.03 
 
 
323 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  28.03 
 
 
323 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  28.03 
 
 
323 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  28.03 
 
 
323 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>