207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1112 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1112  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 
327 aa  641    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0274447  hitchhiker  0.0050668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2534  peptidase M19 renal dipeptidase  48.8 
 
 
331 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2247  peptidase M19 renal dipeptidase  47.01 
 
 
330 aa  285  7e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00766827  normal  0.323905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4630  peptidase M19 renal dipeptidase  40.17 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0672  peptidase M19, renal dipeptidase  33.24 
 
 
356 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6999  peptidase M19 renal dipeptidase  35.19 
 
 
356 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.584329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1025  peptidase M19 renal dipeptidase  32.95 
 
 
356 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134164  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  32.77 
 
 
362 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  33.64 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.23 
 
 
348 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  28.99 
 
 
320 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  27.52 
 
 
307 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  26.39 
 
 
311 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  28.03 
 
 
313 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  27.04 
 
 
312 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  26.85 
 
 
307 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  30.39 
 
 
320 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  25.71 
 
 
307 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  34.82 
 
 
349 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  34.82 
 
 
349 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  27.01 
 
 
307 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  26.51 
 
 
307 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  25 
 
 
307 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  26.51 
 
 
307 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  26.51 
 
 
307 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  25.71 
 
 
307 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  36 
 
 
400 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  26.76 
 
 
307 aa  99.4  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  26.45 
 
 
307 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  32.73 
 
 
342 aa  99  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  31.1 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  32.53 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  27.72 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  32.13 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  30.27 
 
 
311 aa  96.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  25.15 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  31.27 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  33.44 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  31.42 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  25.22 
 
 
328 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  31.86 
 
 
360 aa  93.6  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  36.67 
 
 
342 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  27.63 
 
 
307 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  24.56 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  26.27 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0326  peptidase M19 renal dipeptidase  29.45 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  27.84 
 
 
315 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  31.34 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  31.21 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  27.49 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  35.23 
 
 
355 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  29.69 
 
 
352 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  33.71 
 
 
412 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  31.25 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  30.47 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  26.34 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  31.19 
 
 
352 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  27.45 
 
 
444 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  31 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  25.94 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  35.06 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  31.84 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  28.8 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  31.84 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  35.06 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  27.24 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  29.37 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  26.06 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  29.21 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  33.08 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  27.49 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  23.76 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  30.23 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  32.7 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  32.57 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  24.4 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  24.92 
 
 
438 aa  76.3  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  31.34 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  28.67 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  30.86 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  33.33 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  33.33 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  28.16 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  30.62 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  27.46 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  32.4 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  24.74 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  23.79 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  23.79 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  34.71 
 
 
602 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  31.58 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  31.49 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  23.79 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  22.9 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  24.54 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  23.05 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  23.05 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  23.05 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  31.37 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  29.44 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>