204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6999 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6999  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 
356 aa  738    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.584329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0672  peptidase M19, renal dipeptidase  70.7 
 
 
356 aa  541  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1025  peptidase M19 renal dipeptidase  63.48 
 
 
356 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134164  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  61.28 
 
 
362 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  59.44 
 
 
362 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4630  peptidase M19 renal dipeptidase  37.12 
 
 
350 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2534  peptidase M19 renal dipeptidase  33.7 
 
 
331 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2247  peptidase M19 renal dipeptidase  34.64 
 
 
330 aa  169  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00766827  normal  0.323905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1112  peptidase M19, renal dipeptidase  35.19 
 
 
327 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0274447  hitchhiker  0.0050668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  28.65 
 
 
333 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  28.4 
 
 
311 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  34.35 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  28.87 
 
 
349 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  28.87 
 
 
349 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  29.29 
 
 
344 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  30.08 
 
 
307 aa  106  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  28.14 
 
 
342 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  30.95 
 
 
444 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  28.33 
 
 
327 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  27.12 
 
 
342 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  29.88 
 
 
354 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  25.48 
 
 
313 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  26.13 
 
 
360 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  27.8 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  27.66 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  29.96 
 
 
402 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  25.83 
 
 
311 aa  95.9  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  29.61 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  28.29 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  31 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  25.38 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  28.76 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  29.1 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  25.67 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  27.59 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.3 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  26.89 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  25.35 
 
 
315 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  25.07 
 
 
355 aa  90.5  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2576  peptidase M19, renal dipeptidase  27.68 
 
 
344 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  25.62 
 
 
326 aa  89.7  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  29.18 
 
 
353 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  32.02 
 
 
350 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  26.67 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  27.59 
 
 
412 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  24.86 
 
 
312 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  26.38 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  29.43 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  28.33 
 
 
350 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  29.26 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  28.67 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  28.33 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  31.2 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  25.8 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  27.17 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  25.3 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  27.59 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  31.14 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  26.1 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  27.78 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  29.28 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  27.43 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  25.81 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  26.21 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  23.2 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  27.05 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  26.02 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  23.2 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  25.81 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  26.21 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  26.21 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  26.52 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  26.21 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  34.08 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  30.22 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  25.29 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  28.69 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  26.87 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  26.02 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  28.38 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  28.38 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  28.38 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  25.81 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  25.81 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  26.01 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  27.93 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  25.4 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  26.23 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  25.79 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  30.67 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  25.4 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  25.4 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  25.4 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  25.4 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  25.4 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  30.17 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  28.14 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  25.57 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  25.4 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  25.4 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>