215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4253 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  100 
 
 
359 aa  703    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  68.8 
 
 
345 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  69.01 
 
 
345 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  47.41 
 
 
337 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  35.09 
 
 
333 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  31.83 
 
 
311 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  33.98 
 
 
438 aa  182  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  36.06 
 
 
307 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  36.15 
 
 
311 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  34.22 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  40.57 
 
 
315 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  31.75 
 
 
348 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  32.35 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  30.14 
 
 
328 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  33.73 
 
 
394 aa  156  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  35.01 
 
 
338 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  28 
 
 
419 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  30.69 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  28.74 
 
 
420 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  29.84 
 
 
444 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  30.59 
 
 
388 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  31.49 
 
 
315 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  31.07 
 
 
433 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  35.12 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  28.94 
 
 
602 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  29.8 
 
 
390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  28.65 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  28.19 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  29.25 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  29.39 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  30.46 
 
 
402 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  36.4 
 
 
412 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  37.1 
 
 
418 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  25.89 
 
 
381 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  27.61 
 
 
317 aa  126  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  36.75 
 
 
412 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  29.31 
 
 
399 aa  126  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  35.23 
 
 
315 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  28.65 
 
 
444 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  26.67 
 
 
320 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  28.99 
 
 
415 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  28.57 
 
 
320 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0326  peptidase M19 renal dipeptidase  34.6 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  27.59 
 
 
405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  35.81 
 
 
400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  28.08 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  32.96 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  28.92 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  30.81 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  28.84 
 
 
324 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  31.99 
 
 
350 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  30.91 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  28.2 
 
 
449 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  29.09 
 
 
326 aa  116  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  25.39 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  30.47 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  31.07 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  25.49 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  27.76 
 
 
392 aa  110  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  28.78 
 
 
368 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  28.15 
 
 
393 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  25.93 
 
 
329 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  27.33 
 
 
328 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  30.91 
 
 
357 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  26.82 
 
 
325 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  31.9 
 
 
388 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  29.22 
 
 
387 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  28.61 
 
 
336 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  29.44 
 
 
307 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  29.44 
 
 
307 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  31.56 
 
 
342 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  26.35 
 
 
325 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  29.44 
 
 
307 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  24.64 
 
 
323 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  29.06 
 
 
323 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  25.88 
 
 
325 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  29.3 
 
 
360 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  25.88 
 
 
325 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  25 
 
 
323 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  30.21 
 
 
342 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  29.03 
 
 
307 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  29.25 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  29.44 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  28.76 
 
 
307 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  29.03 
 
 
307 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  30.34 
 
 
307 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  29.46 
 
 
325 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  24.37 
 
 
323 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  25.73 
 
 
323 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  24.37 
 
 
323 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  36.65 
 
 
354 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  24.36 
 
 
323 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  24.36 
 
 
323 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  24.36 
 
 
323 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  30 
 
 
307 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  25.45 
 
 
320 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  31.95 
 
 
349 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  26.32 
 
 
325 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  29.28 
 
 
413 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  25.76 
 
 
325 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>