217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2447 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 		 388 aa  772    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  52.99 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  50.55 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0282  peptidase M19, renal dipeptidase  52.34 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00197146  normal  0.781669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  50.26 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  50 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3395  peptidase M19, renal dipeptidase  51.61 
 
 		 411 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  50.4 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  53.13 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  48.77 
 
 		 389 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  49.28 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.47 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  32.39 
 
 		 328 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  31.68 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  34.07 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  32.85 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  30.7 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  27.37 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  29.2 
 
 		 312 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  29.53 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  28.36 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  28.36 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  27.03 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  35.07 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.77 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  31.25 
 
 		 444 aa  126  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  28.19 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  29.55 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  29.04 
 
 		 602 aa  124  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  27.73 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  35.24 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  30.19 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  29.1 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  29.13 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  31.44 
 
 		 354 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  31.01 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  29.92 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  30.14 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  31.65 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  34.6 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  27.97 
 
 		 342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  30.38 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  30.38 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  30.38 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  30.38 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  30.38 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  29.23 
 
 		 323 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  28.37 
 
 		 346 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  23.71 
 
 		 320 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  28.37 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  28.41 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  27.63 
 
 		 433 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  30.38 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  30.38 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  30.34 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  25.95 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  29.49 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  28.2 
 
 		 317 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  29.23 
 
 		 323 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  29.62 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  28.29 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  27.97 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  24.57 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  27.82 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  27.4 
 
 		 355 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  28.46 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  28.85 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  28.85 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  28.85 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  28.85 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  29.86 
 
 		 412 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  27.69 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  28.46 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  31.94 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  26.32 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  30.62 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  25.07 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  24.51 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  26.61 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  27.31 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  28.06 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  24.51 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  27.4 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  28.74 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.99 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  27.4 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  30.48 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  25.16 
 
 		 307 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  29.09 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  27.59 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  27.42 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  25.08 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  25.13 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  25.16 
 
 		 307 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  27.27 
 
 		 323 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  26.3 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  30.33 
 
 		 312 aa  99.8  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  29.5 
 
 		 412 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  28.57 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>