209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1888 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 
362 aa  748    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  59.94 
 
 
362 aa  458  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6999  peptidase M19 renal dipeptidase  59.44 
 
 
356 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.584329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0672  peptidase M19, renal dipeptidase  56.34 
 
 
356 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1025  peptidase M19 renal dipeptidase  55.77 
 
 
356 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134164  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4630  peptidase M19 renal dipeptidase  35.46 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2534  peptidase M19 renal dipeptidase  31.75 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1112  peptidase M19, renal dipeptidase  33.64 
 
 
327 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0274447  hitchhiker  0.0050668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2247  peptidase M19 renal dipeptidase  30.19 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00766827  normal  0.323905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  28.67 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  28.3 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  33.21 
 
 
333 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  33.19 
 
 
328 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  33.2 
 
 
311 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  29.55 
 
 
349 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  29.55 
 
 
349 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  30.45 
 
 
307 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  34.15 
 
 
313 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  25.89 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  32.76 
 
 
438 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.06 
 
 
348 aa  109  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  26.39 
 
 
352 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  26.33 
 
 
352 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  26.73 
 
 
344 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  27.38 
 
 
402 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  29.17 
 
 
324 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  27.72 
 
 
342 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  29.55 
 
 
320 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  26.79 
 
 
360 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  30.38 
 
 
315 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  28.42 
 
 
353 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  26.64 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  26.58 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  29.78 
 
 
355 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  27.4 
 
 
412 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2576  peptidase M19, renal dipeptidase  29.17 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  30.87 
 
 
327 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  27.08 
 
 
346 aa  96.3  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  27.1 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  26.27 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  30.6 
 
 
350 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  28.34 
 
 
320 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  28.69 
 
 
345 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  27.98 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  26.89 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  29.62 
 
 
355 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  26.19 
 
 
355 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  28.8 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  26.39 
 
 
315 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  27.7 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  26.62 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  30.34 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  28.74 
 
 
359 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  28.11 
 
 
412 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  32.46 
 
 
307 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  28.11 
 
 
418 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  28.57 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  27.46 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  28.57 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  29.07 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  25.4 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  27.34 
 
 
399 aa  87  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  27.66 
 
 
354 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  29.34 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  25.24 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  27.78 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  26.12 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  27.65 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  27.66 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  23.73 
 
 
349 aa  84  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  26.74 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  25.71 
 
 
420 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  29.13 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  26.75 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  28.32 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  26.06 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  25.81 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  27.25 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  25.5 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  28.15 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  24.18 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  27.63 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  27.88 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  24.58 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  27.43 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  27.43 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  27.54 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  23.98 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  27.43 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  25.21 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  25.73 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  27.43 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  27.47 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  24.37 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  24.23 
 
 
400 aa  77  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  24 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  26.82 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  25.64 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  24.38 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>