218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3564 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 		 387 aa  782    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  53.17 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  51.17 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  47.66 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  48.71 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0282  peptidase M19, renal dipeptidase  47.93 
 
 		 386 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00197146  normal  0.781669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  46.44 
 
 		 390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  52.03 
 
 		 389 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  48.48 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3395  peptidase M19, renal dipeptidase  44.57 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  57.33 
 
 		 223 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  30.68 
 
 		 315 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  28.53 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  28.73 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  25.53 
 
 		 317 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  30.42 
 
 		 444 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  29.11 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  35.71 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  30.79 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  30.66 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  32.7 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  31.47 
 
 		 438 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  25.95 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  29.77 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  29.34 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  28.93 
 
 		 352 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  29.86 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  27.81 
 
 		 312 aa  113  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  27.35 
 
 		 313 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  35.08 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  27.76 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  27.76 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  26.18 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  30.43 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.82 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4039  Zn-dependent dipeptidase  44.09 
 
 		 155 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  37.5 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  29.22 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  29.91 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  26.33 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  26.5 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  27.25 
 
 		 307 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  26.54 
 
 		 346 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.64 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  32.22 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  25.5 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  26.95 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  30.81 
 
 		 312 aa  100  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  33.2 
 
 		 307 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  34.38 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  25.77 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  28.63 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  30.25 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  29.83 
 
 		 345 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.47 
 
 		 394 aa  96.3  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  32.02 
 
 		 386 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  24.22 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  30.05 
 
 		 329 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  24.71 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  29.3 
 
 		 602 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  32.48 
 
 		 310 aa  94  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  26.98 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  27.82 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  26.54 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  27.5 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  26.52 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  29.7 
 
 		 323 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  31.08 
 
 		 350 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  27.92 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  27.51 
 
 		 327 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  26.82 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  25.24 
 
 		 449 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6399  peptidase M19 renal dipeptidase  35.35 
 
 		 485 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  26.82 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  27.13 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  25.21 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  29.32 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  24.21 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  24.79 
 
 		 328 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  26.29 
 
 		 420 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  27.69 
 
 		 307 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  29.15 
 
 		 307 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  25.19 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  26.74 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  26.74 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  26.67 
 
 		 444 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  29.71 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  29.77 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  26.74 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  26.74 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  26.74 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  26.74 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  26.74 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  25.85 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17280  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  31.35 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.922551  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 		 433 aa  87.4  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  29.13 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  23.6 
 
 		 326 aa  87.4  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  25.2 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  28.7 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>