216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1052 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1052  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 
310 aa  632  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580265  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  71.84 
 
 
310 aa  478  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  55.02 
 
 
312 aa  341  1e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  42.41 
 
 
307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  39.14 
 
 
326 aa  224  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  39.24 
 
 
307 aa  212  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  42.5 
 
 
306 aa  205  9e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  33.68 
 
 
311 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  34.65 
 
 
315 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  36.2 
 
 
311 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  35.53 
 
 
297 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  33.62 
 
 
307 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  33.93 
 
 
307 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  33.48 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  33.48 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  33.48 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  34.67 
 
 
307 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  34.6 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  33.04 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  33.04 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  31.88 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  31.97 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  35.2 
 
 
329 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  32.9 
 
 
307 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  30.88 
 
 
397 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  32.06 
 
 
312 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  30.99 
 
 
344 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  33.99 
 
 
315 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  29.96 
 
 
307 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  31.13 
 
 
328 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.09 
 
 
315 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  31.09 
 
 
348 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  32.52 
 
 
307 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  28.69 
 
 
342 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  31.55 
 
 
327 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  31.34 
 
 
350 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  30.88 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  29.34 
 
 
353 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  32.64 
 
 
415 aa  98.2  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  27.1 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  29.49 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  32.95 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  28.63 
 
 
387 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  30.63 
 
 
394 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  29.52 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  30.95 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  31.73 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  31.96 
 
 
438 aa  96.3  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  29.78 
 
 
346 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  29.05 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  26.72 
 
 
349 aa  95.5  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  26.72 
 
 
349 aa  95.5  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  30.39 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  27.74 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  30.39 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  29.65 
 
 
381 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  30.08 
 
 
328 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  28.94 
 
 
393 aa  93.2  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  32 
 
 
368 aa  92.8  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  27.16 
 
 
355 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  32.21 
 
 
223 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  28.7 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  27.39 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  28.17 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  26.95 
 
 
342 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  29.1 
 
 
323 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  33.55 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  32.95 
 
 
388 aa  89.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  28.77 
 
 
323 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2534  peptidase M19 renal dipeptidase  26.16 
 
 
331 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  27.45 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  30.72 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  33.33 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  27.94 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  27.2 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  30.57 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2247  peptidase M19 renal dipeptidase  25.88 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00766827  normal  0.323905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  30.05 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  27.92 
 
 
388 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  28.05 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  27.49 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  30 
 
 
390 aa  86.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  31.33 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  30.77 
 
 
325 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  29.63 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  30.77 
 
 
325 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  27.9 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  30.77 
 
 
325 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  30.77 
 
 
325 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  31.69 
 
 
332 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  29.95 
 
 
323 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  32.53 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  26.76 
 
 
385 aa  85.5  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  27.85 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  31.07 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  25.95 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  26.32 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  27.85 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  30.69 
 
 
602 aa  84.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  29.53 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>